Ambion™ Mélanges ERCC ExFold RNA Spike-In

Les mélanges ERCC ExFold RNA Spike-In fournissent un ensemble de contrôles d’ARN externes qui permettent d’évaluer les performances d’une variété de plateformes technologiques utilisées pour les expériences d’expression génétique. Ajoutez un mélange Spike-In à chaque échantillon d’ARN et faites traiter les échantillons contenant le mélange Spike-In par votre plateforme. Comparez ensuite les données du mélange Spike-In aux concentrations et aux rapports Spike-In Mix connus pour évaluer la plage dynamique, la limite inférieure de détection et la réponse d’accroissement-changement de votre plateforme. Un certain nombre de technologies d’expression de gènes peuvent bénéficier de l’utilisation des mélanges d’ARN ExFold ERCC, y compris le séquençage de nouvelle génération (NGS ), les microtubes et les tests PCR. Les biopuces doivent contenir des sondes conçues pour interroger les transcrits ERCC afin de bénéficier de l’utilisation des mélanges ERCC ExFold RNA Spike-In. Consultez le fabricant du réseau pour plus de précisions. Caractéristiques du produit principales :

Obtenez une mesure standard pour comparer les données entre diverses expériences d’expression génétique.

Mesurez la sensibilité (limite inférieure de détection) et l’échelle dynamique d’une expérience.

Quantifier l’expression différentielle des gènes

pourquoi des contrôles ARN externes sont nécessaires ;
La variation des données d’expression de l’ARN peut être attribuée à divers facteurs, notamment la qualité du matériel de départ, le niveau de cellularité et le taux d’ARN, la plateforme utilisée et la personne qui réalise l’expérience. Pour contrôler ces sources de variabilité, un ensemble commun de contrôles d’ARN externes a été développé par le Consortium de contrôles d’ARN externes (ERCC), un groupe ad hoc d’organisations universitaires, privées et publiques hébergé par l’Institut national des normes et des technologies (NIST ). Ces contrôles sont composés d’un ensemble de transcripts non marqués et polyadénylés, à ajouter aux analyses d’ARN après l’isolement d’échantillons en vue d’effectuer des mesures par rapport aux critères de performance définis. Avant la conception de ces contrôles universellement acceptés, une enquête approfondie des matrices de performance analytique de base était difficilement réalisable. Issus de la marque connue des réactifs d’ARN de qualité, les mélanges ERCC ExFold Spike-In sont des mélanges commercialisés et pré-formulés de 92 transcripts, dérivés et traçables à partir de plasmides d’ADN certifiés par NIST. Les transcriptions sont conçues pour avoir une longueur de 250 à 2 000 nt, qui imitent les ARNm eucaryotiques naturels.

Révéler le potentiel de l’analyse de l’ARN
L’analyse de l’ARN, y compris le profilage de l’expression génique et l’enquête du transcriptome entier, peut conduire à une meilleure compréhension des schémas d’expression dans les états pathologiques et fournir de plus amples informations sur les voies biologiques et les mécanismes moléculaires qui régulent le destin cellulaire, le développement et la progression de la maladie. Les méthodes traditionnelles de l’analyse d’ARN, comme la qRT-PCR et les microréseaux, sont bien établies mais remplacées par le séquençage de nouvelle génération, une alternative numérique à haut débit. Étant donné que chaque méthode comporte plusieurs plateformes et face à la nécessité de comparer plusieurs échantillons sur des plateformes dans le monde entier, une mesure standard s’impose pour comparer les données. À mesure que les capacités de l’analyse de l’ARN s’étendent, la nécessité de créer une vue standardisée des données devient encore plus importante.

Obtenir et comparer les résultats avec l’exactitude confirmée
Les mélanges ExFold ARN de ERCC sont utilisés pour créer une mesure de référence standard de l’ARN à la fois dans une expérience et à travers plusieurs expériences réalisées à l’aide de divers échantillons et plateformes. Grâce aux deux formulations de mélange spike-in (voir la figure), plusieurs mesures, comme la sensibilité ou l’échelle dynamique, peuvent être examinées pour accéder à divers paramètres dans une ou plusieurs expériences (voir la figure). Qui plus est, vous pouvez calculer les taux d’accroissement-changement de l’expression entre deux échantillons en toute confiance en vous rapportant à la relation hautement concordante entre le mélange ExFold RNA Spike-In 1 et le mélange ExFold RNA Spike-In 2 (voir la figure). Les mesures sont déterminées par des concentrations molaires connues pour chaque transcript dans un mélange spike-in et par l’association de deux mélanges en utilisant une combinaison de taux sur 4 sous-groupes de 92 transcripts. Les contrôles sont idéaux pour les expériences de séquençage de nouvelle génération, telles que sur SOLiD™ et les plateformes de microessai prises en charge telles que le Illumina™ Sentrix™ dépistage de la puce.

Choisissez parmi les options flexibles pour les configurations de kits ERCC
Qu’il s’agisse de mesure de la plage dynamique ou de la flexion de l’expression génique, les mélanges de contrôle Spike-In ERCC sont disponibles en deux configurations de kits pour répondre à vos besoins expérimentaux. Utilisez le mélange ERCC Spike-In pour déterminer l’échelle dynamique et la limite inférieure de détection sur votre plateforme. Utilisez aussi les mélanges ERCC ExFold Spike-In pour évaluer la précision des mesures d’expression génétique différentielle.

	ERCC ARN Spike-In Mix 1*	Mélange à aiguille ExFold 1*	Mélange à épiler ExFold 2*	Eau exempte de nucléase
Mélange d’ARNc pour analyse de l’ARN (cata. N° 4456740)	10 μL	—	—	1,75 ml
Mélanges à pointe d’ARN ExFold ERCC (numéro de cat. 4456739)	—	10 μL	10 μL	1,75 ml

*Bien que le test ERCC ARN Spike-In Comb 1 et ExFold Spike-In Mix 1 contiennent la même formulation de transcrits de ERCC, ne remplacez pas le mélange ERCC ARN Spike-In Mix 1 par ExFold Spike-In Mix 1 pour l’évaluation des plis. Utilisez uniquement les mélanges ExFold Spike-In 1 et 2 dotés du même numéro de lot du fabricant.