Ambion™ Mélange ERCC ARN Spike-In

La variation des données d’expression de l’ARN peut être attribuée à plusieurs facteurs, notamment la qualité du produit de départ, le niveau de cellularité et le rendement en ARN, ainsi que la plateforme utilisée et la personne chargée de mener l’expérience. Pour contrôler ces sources de variabilité, un ensemble commun de contrôles d'ARN externes a été développé par le Consortium des contrôles d'ARN externes (ERCC), un groupe ad hoc d'organisations universitaires, privées et publiques hébergé par le National Institute of Standards and Technology (NIST ). Ces contrôles sont composés d’un ensemble de transcripts non marqués et polyadénylés, à ajouter aux analyses d’ARN après l’isolement d’échantillons en vue d’effectuer des mesures par rapport aux critères de performance définis. Avant la conception de ces contrôles universellement acceptés, une enquête approfondie des matrices de performance analytique de base était difficilement réalisable. De la marque de confiance de réactifs ARN de qualité, Ambion™ Les mélanges de contrôle ERCC Spike-In sont des mélanges préformulés disponibles dans le commerce, composés de 92 transcrits, dérivés et traçables à partir de plasmides d'ADN certifiés NIST. Les transcrits sont conçus pour avoir une longueur de 250 à 2 000 nucléotides, imitant ainsi les ARNm eucaryotes naturels.

Principales caractéristiques du produit :

Établir une mesure standard pour la comparaison des données entre les expériences d'expression génique

Mesurez la sensibilité (limite inférieure de détection) et l’échelle dynamique d’une expérience.

Quantifier l'expression différentielle des

gènes : exploiter le potentiel de l'analyse de l'ARN.
L'analyse de l'ARN, incluant le profilage de l'expression génique et l'étude du transcriptome complet, peut conduire à une meilleure compréhension des profils d'expression dans les états pathologiques et offre une meilleure compréhension des voies biologiques et des mécanismes moléculaires qui régulent le destin cellulaire, le développement et la progression de la maladie. Les méthodes traditionnelles de l’analyse d’ARN, comme la qRT-PCR et les microréseaux, sont bien établies mais remplacées par le séquençage de nouvelle génération, une alternative numérique à haut débit. Étant donné que chaque méthode comporte plusieurs plateformes et face à la nécessité de comparer plusieurs échantillons sur des plateformes dans le monde entier, une mesure standard s’impose pour comparer les données. À mesure que les capacités d'analyse de l'ARN se développent, la nécessité de créer une vision standardisée des données deviendra encore plus importante.

Obtenez et comparez des résultats avec une précision confirmée.
Ambion™ Les contrôles d'ARN ERCC Spike-In sont utilisés pour créer une mesure de base standard de l'ARN à la fois au sein d'une expérience et entre plusieurs expériences réalisées à l'aide de divers échantillons et plateformes. Grâce aux deux formulations de mélange spike-in (figure 1), plusieurs mesures, comme la sensibilité ou l’échelle dynamique, peuvent être examinées pour accéder à divers paramètres dans une ou plusieurs expériences (figure 2). Qui plus est, vous pouvez calculer les taux d’accroissement-changement de l’expression entre deux échantillons en toute confiance en vous rapportant à la relation hautement concordante entre le mélange ExFold RNA Spike-In 1 et le mélange ExFold RNA Spike-In 2 (figure 3). Les mesures sont déterminées par des concentrations molaires connues pour chaque transcript dans un mélange spike-in et par l’association de deux mélanges en utilisant une combinaison de taux sur 4 sous-groupes de 92 transcripts. Ces contrôles sont idéaux pour les expériences de séquençage de nouvelle génération, comme par exemple sur SOLiD™ Système et plateformes de microarrays prises en charge telles que Illumina™ Sentrix™ Puce à perle.

Choisissez parmi les options flexibles pour les configurations de kits ERCC,
que ce soit pour mesurer la plage dynamique ou le changement d'expression génique, Ambion™ Les mélanges de contrôle ERCC Spike-In sont disponibles en deux configurations de kit pour répondre à vos besoins expérimentaux. Utilisez le mélange ERCC Spike-In pour déterminer l’échelle dynamique et la limite inférieure de détection sur votre plateforme. Utilisez aussi les mélanges ERCC ExFold Spike-In pour évaluer la précision des mesures d’expression génétique différentielle.

	Mélange d'ARN ERCC 1*	Mélange ExFold Spike-In 1*	ExFold Spike-In Mix 2*	Eau exempte de nucléase
Mélange d'ARN ERCC (réf. 4456740)	10 μL	—	—	1,75 ml
Mélanges d'ARN ERCC ExFold (Réf. 4456739)	—	10 μL	10 μL	1,75 ml

*Bien que les mélanges ERCC RNA Spike-In Mix 1 et ExFold Spike-In Mix 1 contiennent la même formulation de transcrits ERCC, ne substituez pas le mélange ERCC RNA Spike-In Mix 1 au mélange ExFold Spike-In Mix 1 pour l'évaluation du facteur de changement. Utilisez uniquement les mélanges ExFold Spike-In Mix 1 et Mix 2 portant le même numéro de lot de fabrication.

Réservé à la recherche. Ne pas utiliser pour des procédures de diagnostic.