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OPTIZYME™ AloI, Fisher BioReagents™

Code produit. 11994822
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Quantité:
100 U
Conditionnement:
1 pièce
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Code produit. 11994822

Marque: Fisher BioReagents BP80751

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5’...^ 7(N) G A A C (N)6 T C C (N)12-13^...3’
3’...^12-13(N) C T T G (N)6 A G G (N)7 ^...5’

Fourni avec : Tampon OPTIZYME 10X5
Conditions pour 100 % d’activité :

  • 1Tampon X OPTIZYME 5 : 10 mM de tris-HCl (pH 8,5 à 37°C), 10 mM de MgCl2, 100 mM de KCl et 0,1 mg/ml de BSA
  • Laissez incuber à 30°C
Activité enzymatique dans les tampons OPTIZYME :
  • Tampon 1 : 0 - 20 %
  • Tampon 2 : 0 - 20 %
  • Tampon 3 : 0 - 20 %
  • Tampon 4 : 20 - 50 %
  • Tampon 5 : 100 %
Tampon de stockage :
  • 10mM de tris-HCl (pH 7,4 à 25°C), 100 mM de KCI, 1 mM de DTT, 1 mM d’EDTA, 0,2 mg/ml de BSA et 50 % (v/v) de glycérol
  • Ligature et nouveau clivage :
  • Environ 70 % des fragments d’ADN peuvent être ligaturés et plus de 80 % d’entre eux peuvent être recoupés après digestion excessive multipliée par 10 fois avec AloI.
  • Remarques :
    • L’incubation à 37°C se traduit par une activité de 20 %.
    • AloI produit des coupes double brin des deux côtés depuis le site de reconnaissance interrompu. Sa fonction exclusive est un point de clivage dégénéré sur le côté 3’ de la séquence de reconnaissance (à 12 ou 13 nucléotides).
    • La présence de S-adénosylméthionine dans le mélange réactionnel se traduit par un clivage incomplet avec AloI.
    • Une digestion avec un excès de 10 fois de AloI peut induire une activité Star.
    • AloI peut rester associée à l’ADN clivé. Cela peut provoquer un décalage de la bande d’ADN pendant l’électrophorèse. Pour éviter de voir des bandes d’ADN atypiques, utiliser le colorant de charge d’ADN 6X et une solution SDS pour la préparation des échantillons, ou chauffer l’ADN digéré en présence de SDS avant l’électrophorèse.
    Effets de méthylation :
    Dam : Risque de chevauchement - effet non déterminé
    • 5’...GAAC(N)4Gm6A TCC...3’
  • 3’...CTTG(N)4C Tm6AGG...5’
  • (Effet de clivage non déterminé)
  • Dcm : Possibilité de chevauchement - aucun effet.
    • 5’...GAAC(N)6TCm5CW GG...3’
  • 3’...CTTG(N)6AG GWm5CC...5’
  • (Aucun effet sur le clivage)
  • CpG : Risque de chevauchement - altération du clivage
    • 5’...m5C GAAC(N)6TCC...3’
  • 3’… Gm5CTTG(N)6AGG...5’
  • (Le clivage est bloqué)
    • 5’...GAAC(N)6TCm5C G...3’
  • 3’...CTTG(N)6AG Gm5C...5’
  • (Aucun effet sur le clivage)
    • 5’...GAAm5C G(N)5TCC...3’
  • 3’...CTT Gm5C(N)5AGG...5’
  • (Aucun effet sur le clivage)
  • EcoKI : Ne se chevauche jamais - aucun effet
  • EcoBI : Ne se chevauche jamais - aucun effet
  • TRUSTED_SUSTAINABILITY

    Spécification

    Concentration 1 à 3 U/μl
    Composants 25 à 50 % d’eau, > 50 % de glycérine
    Température de l’incubateur 30°C
    pH 7,4
    À utiliser avec (application) > 95 % des fragments d’ADN peuvent être ligaturés et recoupés après une digestion excessive multipliée par 50 avec AloI
    Tampon de stockage 10 mM de Tris HCl (pH 7,4 à 25°C), 100 mM de KCl, 1 mM d’DTT, 1 mM de EDTA, 0,2 mg/ml de BSA, 50 % de glycérol
    Contenu et stockage Garder le récipient hermétiquement fermé
    Quantité 100 U
    Site de coupe (7/12)GAAC(N)6TCC(12/7)
    Type de produit AloI
    Forme Liquide
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