Applied Biosystems™ TaqMan™ Copy Number Reference Assay, mouse, Tfrc

Les dosages de référence du nombre de copies TaqMan™ de souris sont effectués avec les dosages du nombre de copies préconçus, Custom Plus et Custom TaqMan™ dans les réactions en duplex PCR en temps réel afin de détecter et de mesurer les variations du nombre de copies dans le génome de souris.Les dosages de référence du nombre de copies TaqMan™ de souris sont également compatibles avec les dosages du nombre de copies TaqMan™ préçoncus du gène rapporteur et du marqueur de vecteur commun.Deux options sont proposées pour les gènes pouvant être utilisés comme gènes de référence endogènes :Tfrc et Tert.Les dosages de référence du nombre de copies TaqMan™ sont conçus pour les séquences génomiques uniques dans l’ensemble de référence du génome de souris (NCBI Build 37/mm9) et sont nécessaires pour l’analyse quantitative relative du nombre de copies cibles.

Les essais du nombre de copies TaqMan™ quantifient les gènes d’intérêt et les normalisent selon un gène de référence endogène connu pour être présent en deux copies dans un génome diploïde.Veuillez noter que les dosages de référence du nombre de copies TaqMan™ sont spécifiques à chaque espèce.

Tfrc :L’option de gène de référence standard
Les dosages de référence du nombre de copies TaqMan™ possèdent une sonde TAMRA™ marquée par un colorant VIC™ et des amorces sens et antisens spécifiques à une séquence de référence.Les dosages ne sont pas limités par des amorces.

Le dosage de référence du nombre de copies TaqMan™, de souris, Tfrc est recommandé comme dosage de référence standard pour les analyses du nombre de copies chez la souris.Ce dosage détecte le gène récepteur de la transferrine (Tfrc) sur le chromosome 16, cytobande 16qB3.L’emplacement de l’essai est le chr.16:32626732 sur NCBI version 37.Il a un amplicon de 91 bp qui cartographie dans l’exon 17 du gène Tfrc.

Le dosage de référence du nombre de copies TaqMan™, de souris, Tert est un dosage de référence alternatif. Il est recommandé dans le cas où le dosage de Tfrc fonctionnerait mal sur un échantillon en raison d’une aberration chromosomique ou d’autres problèmes.Ce dosage cible le gène de la transcriptase inverse de la télomérase (Tert), situé sur le chromosome 13, cytobande 13qC1.L’emplacement de l’essai est le chr.13:73778992 sur NCBI version 37.Il a un amplicon de 96 bp qui cartographie dans l’intron 8 du gène Tert.

Flux de travail le plus simple disponible
Les dosages du nombre de copies TaqMan™ présentent le flux de travail le plus simple de toutes les méthodes d’analyse CNV actuellement disponibles.Le dosage de test (marqué par colorant FAM™), le dosage de référence (marqué par colorant VIC™), votre échantillon d’ADN et le Master Mix TaqMan™ sont associés et appliqués sur un système PCR en temps réel Applied Biosystems™ en suivant le protocole de dosage du nombre de copies TaqMan™ standard.En moyenne, la mise en place de l’analyse primaire ne prend que 3 à 4 heures (incluant un cycle PCR d’environ 2 heures).

Logiciel d’analyse de données puissant
Le logiciel CopyCaller™ a été spécifiquement développé pour l’analyse des données du dosage du nombre de copies TaqMan™.Ce logiciel gratuit et convivial utilise une interface graphique qui calcule rapidement les nombres de copies possibles pour l’ensemble des échantillons d’un cycle.Il apporte également une valeur de confiance pour chaque appel de nombre de copies et dispose d’une fonction de déviance.

Usage exclusivement réservé à la recherche.Non utilisé à des fins thérapeutiques ou diagnostiques humaines ou animales.