Invitrogen™ Réactifs de fragmentation de l’ARN

Le protocole est simple, rapide et peut être complété en moins de 20 min. La quantité de réactifs Invitrogen™ fournie est suffisante pour 200 réactions. De nombreux protocoles pour l’utilisation de l’ARN amplifié dans l’analyse par la microarray recommandent de fragmenter l’aRNA avant l’hybridation avec une microarray à oligonucléotides. Cette étape de fragmentation améliore la cinétique d’hybridation avec les oligonucléotides avec des puces et peut conduire à l’amélioration du signal. Le protocole est simple. Mélangez l’aRNA avec le réactif de fragmentation de l’ARN Invitrogen (10X) et chauffez à 70°C pendant 15 minutes. La réaction est ensuite arrêtée par l’ajout de la solution d’arrêt et placée sur de la glace jusqu’à ce qu’elle soit prête à être hybridée avec la microarray. La taille moyenne des fragments obtenus sera de 60 à 200 nucléotides. Jusqu’à 10 μg d’ARN peuvent être fragmentés dans une réaction de 10 μl.

Analyse de l’expression génétique et génotypage, analyse de la microarray